La URV estructura su sistema de planificación en torno a los planes estratégicos, por un lado, y la planificación operativa, por otro.

En 1998, se elaboró un Plan Estratégico de la URV, que ha sido el marco general de referencia para redactar posteriormente los planes estratégicos de las unidades (centros y departamentos) y los planes estratégicos sectoriales. Respecto a los primeros, se elaboró un plan por unidad (un total de treinta) y se presentaron en octubre de 1999.

Respecto a los planes estratégicos sectoriales, el Plan Estratégico de Investigación se acabó en diciembre de 2001 y actualmente se está trabajando en el Plan Estratégico de Docencia y en el Plan Estratégico de la Unidad de Estudiantes.

La planificación estratégica operativa se ha concretado en el desarrollo de los contratos programa con cada centro departamento.